Baitul Maal Al Ikhwan selaku pengelola dana ZIS tentunya juga menerima dan menghimpun dana Zakat baik dari masyarakat umum, anggota, maupun dari internal sendiri. Untuk pentasharufan zakat selama ini lebih banyak menyasar ke janda-janda yang sudah berusia renta dan tidak berpenghasilan serta tidak mampu secara ekonomi, dan muallaf serta dhuafa. Penyaluran berupa paket sembako yang diberikan rutin setiap bulan. Dan untuk ke depannya dana zakat yang terhimpun juga akan ditasahrufkan melalui program pemberdayaan kaum dhuafa’.